Présentation de la proposition de thèse doctorale
de
Prudencio Tossou
Le lundi 21 août 2017 à 13 h
Local 3904, Pavillon Adrien Pouliot
Améliorer la découverte de médicaments
grâce à l’apprentissage automatique
Membres du jury
Mario Marchand, Ph.D. (Directeur de recherche)
Département d’informatique et de génie logiciel
Jacques Corbeil, Ph.D. (Co-directeur de recherche)
Centre Hospitalier de l’Université Laval – CHUL
François Laviolette, Ph.D. (Examinateur)
Département d’informatique et de génie logiciel
Résumé
Cette proposition présente nos travaux portant sur le développement d’algorithmes pour assister et diriger la chimie combinatoire dans la recherche de peptides de forte affinité à une protéine cible. Nos algorithmes servent notamment à l’obtention de prédicteurs précis de la bioactivité des peptides, l’inférence des peptides maximisant la sortie d’un prédicteur de la bioactivité et la conception de motif informatif maximisant le rendement de l’expérience de chimie combinatoire. Ces algorithmes sont mis en oeuvre dans une boucle de rétroaction in vitro — in silico, qui consiste à d’extraire le maximum d’informations des données produites après une expérience de chimie combinatoire, puis proposer un motif de synthèse pour une nouvelle. Les résultats préliminaires montrent des améliorations significatives de l’expérience de chimie d’une itération démontrant de l’effectivité des algorithmes de d’apprentissage dans ce processus.
Bienvenue à tous !
